函館バスに在籍している車両は，自社導入だけでなく移籍車両も含まれている。移籍車両のうち，東急バスや京浜急行バスからの車両が多い。そこで，前所有者時代の車番において，判別しているものに関しては併せて明記しておいた。ここでは東急バスの車番について説明しておきたい。

〈東急バス〉
東急バスの車番は，3桁もしくは4桁の数字に所属営業所を示すアルファベットが表記されている。アルファベットに関しては，A（淡島），SI（下馬），T（弦巻），S（瀬田），M（目黒），E（荏原），I（池上），TA（高津），KA（川崎），NI（新羽），AO（青葉台），NJ（虹ヶ丘），H（東山田）をそれぞれ表していて，淡島～池上は東京都，高津～東山田は神奈川県にそれぞれ営業所がある。（※ただし，川崎営業所は2010年度をもって営業を終了している）。
また数字においては，車両の導入年度を表している。数字の下2桁は原則として，日デ→日野→いすゞ→三菱ふそうの順番で振られている（わかりやすいように，車種の区切りごとにカンマを入れておいた）。
以下の表は，年度ごとに導入された車番を示したものである（路線バス型をメインに表記した）。

1997年：1600～1614，1625～1638，1650～1662，1675～1699
1998年：1700～1707，1725～1736，1750～1752，1775～1794
1999年：1800～1803，1825～1838，1850～1856，1875～1885
2000年：1900～1904，1975～1979
2001年：200～212，225～237，250～258，275～291
2002年：300～321，322～352，353～369，371～399
2003年：400～425，426～447，450～465，467～499
2004年：500～520，525～548・568・569，550～565，570～599
2005年：600～624，625～643，650～668，672～699・6675～6686
2006年：700～731，732～762・790・7732～7734，763～783・791，7700～7728
2007年：8700～8730，8731～8749・6727～6732，8752～8756，8770～8796
2008年：800～827，828～849，850～868・899，869～896
2009年：900～906，925～931，950～957，975～983
（※2000年度に関しては日デと三菱ふそうの2メーカーのみの導入となった）

しかし，近年は東急バスだけではなく，京急バスからの移籍車両も増加傾向にある。また，2019年には立川バス，2023年には船橋新京成バスからの移籍車両も誕生した。