〈かつて担当していた路線〉※主に市営バス移管後に廃止となった路線を紹介する。なお，経由地に関しては主要な停留所を表記している。
※ダイヤに関しては基本的に平日・土日祝日共通ダイヤである。
※学休ダイヤ⇒日曜・祝日および学休日（学休日の土曜日も含む）は運休することを表している。
・⇔は往復運行あり，⇒や← は片道運行のみをそれぞれ表している。
・（）表記に関しては一部便で経由することを示している。
・2019年4月1日以降に廃止になった路線については，旧系統番号もあわせて表記した。
・函館駅前停車の系統は，わかりやすくするために乗り場（①や②など）の表記も加えた
快速大成号 ※1日1本
・バスセンター⇔函館駅前⑬⇔昭和橋⇔五稜郭⇔亀田支所前⇔昭和⇔開発⇔鶉⇔厚沢部⇔江差病院前⇔水堀⇔乙部⇔元和⇔相沼⇔鮎川⇔熊石⇔あわび山荘前⇔宮野⇔大成学校前
※バスセンター便において，開発 までは乗車専用停留所，大成学校前発便において，開発 以降は降車専用停留所となっていた。
※大成号が廃止になった後，大成号代替便が運行されていたが，それも廃止となってしまった。
函館・長万部線 ※1日1本（日祝日及び学休日は運休）
・長万部ターミナル⇔長万部駅前⇔平里
※函館・長万部線は現在310系統および311系統として運行している。
江差・松前線
・江差ターミナル⇔江差駅前⇔江差病院前（⇒江差高校前） ⇔江差駅前⇔江差ターミナル⇔大崎⇔石崎⇔小砂子⇔原口⇔赤石⇔江良⇔館浜⇔松前出張所⇔松前役場前
・江差ターミナル⇔南が丘団地（⇒江差南高校前）⇔江差病院前⇔江差高校前 ※1日1本（日祝日は運休）
※江差・松前線は現在，一部を621系統および622系統〈江差・小砂子線〉として運行している。
鰔川・旭岱線 ※一部フリー乗降区間あり
・江差ターミナル⇔南が丘団地（⇔江差高校前）⇔水堀⇔鰔川西⇔旭岱
※一部便では 水堀 にて接続バスが用意されていた。
大檜線 ※1日4本（うち1本は土日祝日および学休日は運休）
・北桧山⇔元町⇔生渕⇔大檜⇔鵜泊団地
731系統 ※一部フリー乗降区間あり
・江差ターミナル⇔陣屋団地⇔姥神町フェリー前⇔江差病院前⇔乙部⇔元和⇔相沼⇔鮎川⇔熊石⇔熊石病院前⇔あわび山荘前⇔宮野⇔久遠東部⇔大成総合支所前⇔大成学校前
※一部便では 宮野 にて接続バスが用意されていた。
732系統 ※1日1本，すべてフリー乗降区間
・大成学校前⇒第一富磯⇒第二富磯⇒太田
733系統
・（太田⇒）第二富磯⇒大成学校前⇒大成総合支所前⇒久遠東部⇒宮野⇒あわび山荘前⇒熊石病院前⇒熊石⇒鮎川⇒元和⇒乙部（⇒江差高校前）⇒江差病院前⇒姥神町フェリー前⇒陣屋団地⇒江差ターミナル
※第二富磯発の一部便では 江差病院前 にて接続バスが用意されていた
745系統 ※1日2本
・大成学校前⇒第一富磯⇒第二富磯
〈※731・732・733・745系統はもともと 桧山海岸線〉
623系統 〈江差・八雲線〉 ※1日2本
・江差ターミナル⇔南が丘団地⇔姥神町フェリー前⇔江差病院前⇔水堀⇔乙部⇔元和⇔相沼⇔熊石⇔鮎川見市温泉⇔八雲高校⇔八雲駅前⇔八雲総合病院
※2021年9月をもって廃止。
99B系統急行 ※1日1本，一部通過する停留所あり
・椴法華支所⇒古部⇒木直⇒尾札部⇒南茅部支所前⇒川汲⇒鉄山⇒亀尾⇒湯倉神社前⇒五稜郭⇒昭和橋⇒函館駅前⇒バスセンター
321系統 〈濁川線〉 ※平日のみ運行
・渡島信用金庫前⇒森駅前⇒森国保病院前⇒森駅前⇒濁川温泉⇒三岱入口
※2020年7月より片道運行。以前は 森案内所⇔三岱入口 までの経路であった。
※2022年10月をもって廃止。
312系統特急 〈三岱線〉 ※1日1本（平日のみ運行）
・三岱入口⇒濁川温泉⇒森駅前⇒森国保病院前⇒森駅前⇒渡島信用金庫前⇒赤井川⇒峠下⇒峠下小学校前⇒七飯役場通⇒大中山⇒桔梗⇒昭和⇒五稜郭駅前⇒ガス会社前⇒函館駅前⇒バスセンター
※峠下小学校前⇒函館駅前は特急便となり，七飯役場通・大中山・桔梗・昭和・五稜郭駅前・ガス会社前のみ停車となる。
※2023年3月をもって廃止。
函館・知内線
・木古内駅前⇔知内主張所（⇔こもれび温泉）⇔小谷石
※函館・知内線は現在410系統として運行している。
411系統 〈函館・知内戦〉 ※土日祝日は1本のみ運行
・小谷石⇔こもれび温泉⇔知内出張所⇔知内出張所⇔森越⇔木古内駅前⇔札苅⇔泉沢駅前⇔当別トラピスト入口⇔茂辺地⇔富川会館前⇔上磯駅前通⇔久根別⇔石田文具前⇔北大前⇔市立函館病院⇔亀田小学校前⇔五稜郭⇔昭和橋⇔函館駅前⑥⇔バスセンター
※2023年9月をもって廃止。
641系統 ※1日1本（日祝日は運休），一部フリー乗降区間あり
・江差ターミナル⇒南が丘団地⇒江差中学校前⇒姥神町フェリー前⇒江差病院前⇒厚沢部⇒鶉⇒東部館⇒富里
※2024年3月をもって廃止。
642系統 ※1日1本，一部フリー乗降区間あり
・江差ターミナル⇒鴎島入口⇒姥神町フェリー前⇒江差病院前⇒江差高校前⇒水堀⇒赤沼⇒厚沢部⇒鶉⇒東部館⇒富里
※2024年3月をもって廃止。
643系統 ※1日1本，一部フリー乗降区間あり
・富里⇒東部館⇒鶉⇒厚沢部⇒赤沼⇒水堀⇒江差病院前⇒姥神町フェリー前⇒陣屋団地⇒江差ターミナル
※2024年3月をもって廃止。
※水堀にて接続バスが用意されていた。
644系統 ※1日1本（日祝日は運休），一部フリー乗降区間あり
・富里⇒東部館⇒鶉⇒厚沢部⇒江差高校前⇒江差病院前⇒姥神町フェリー前⇒江差中学校前⇒南ヶ丘団地⇒江差ターミナル
※2024年3月をもって廃止。
※鶉にて接続バスが用意されていた。
651系統 ※1日1本（日祝日は運休），一部フリー乗降区間あり
・稲見⇒滝野⇒赤沼⇒水堀⇒江差高校前⇒江差病院前⇒姥神町フェリー前⇒鴎島入口⇒江差ターミナル
※2024年3月をもって廃止。
652系統 ※1日1本，一部フリー乗降区間あり
・江差ターミナル⇔陣屋団地⇔姥神町フェリー前⇔江差病院前⇔水堀⇔赤沼⇔滝野⇔稲見
※2024年3月をもって廃止。
※江差ターミナル発便は 日祝日 が運休となり，稲見発便は 土日祝日・学休日 が運休であった。
653系統 ※1日1本（土日祝日・学休日は運休），一部フリー乗降区間あり
・江差ターミナル⇒南が丘団地⇒江差中学校前⇒姥神町フェリー前⇒江差病院前⇒水堀⇒赤沼⇒滝野⇒稲見
※2024年3月をもって廃止。
661系統 ※1日1本（日祝日は運休），一部フリー乗降区間あり
・江差ターミナル⇔南が丘団地⇔江差中学校前⇔姥神町フェリー前⇔江差病院前⇔水堀⇔赤沼⇔厚沢部⇔鶉⇔東部館
※2024年3月をもって廃止。
662系統 ※1日1本（平日のみ運行），一部フリー乗降区間あり
・江差ターミナル⇔鴎島入口⇔姥神町フェリー前⇔江差病院前⇔厚沢部⇔鶉⇔東部館
※2024年3月をもって廃止。
〈※641～662系統はもともと 館線・稲見線〉
663系統 〈木間内線〉 ※1日1本（土日祝日・学休日は運休），一部フリー乗降区間あり
・上木間内⇒鶉⇒厚沢部⇒江差高校前⇒江差病院前⇒姥神町フェリー前⇒鴎島入口⇒江差ターミナル
※2024年3月をもって廃止。
510系統 〈快速松前号〉 ※一部便では土日祝日運休の便あり
・松前出張所⇔松前病院前⇔白神下町⇔吉岡⇔福島⇔しりうち道の駅⇔知内出張所⇔森越⇔木古内駅前⇔札苅⇔泉沢駅前⇔茂辺地⇔富川会館前⇔上磯駅前通⇔石田文具前⇔西桔梗⇔昭和⇔昭和ターミナル⇔亀田中学校前⇔亀田支所前⇔五稜郭⇔千代台⇔昭和橋⇔函館駅前⑥⇔バスセンター
※以前は，乗車専用停留所と降車専用停留所が存在していた。また、亀田支所前ではなく市立函館病院を経由する便も存在していた。
※2024年9月をもって廃止。
511系統
・バスセンター⇒函館駅前⑥⇒昭和橋⇒五稜郭⇒亀田支所前⇒亀田中学校前⇒昭和ターミナル⇒昭和⇒西桔梗⇒石田文具前⇒上磯駅前通⇒富川会館前⇒茂辺地⇒泉沢駅前⇒札苅⇒木古内駅前⇒森越⇒知内出張所⇒知内高校前⇒しりうち道の駅⇒福島⇒吉岡⇒白神下町⇒松前病院前⇒松前出張所
※2023年10月に新設し，2024年9月をもって廃止。
※知内高校前は平日のみ停車していた。
313系統快速 ※1日1本（平日のみ運行）
・森駅前⇒渡島信用金庫本店⇒姫川⇒赤井川⇒峠下⇒峠下小学校前⇒七飯役場通⇒大中山⇒桔梗⇒昭和⇒ガス会社前⇒五稜郭駅前⇒函館駅前⇒バスセンター
※2020年4月に新設（かつては土日祝日のみの運行であった）。2024年9月をもって廃止。
※峠下小学校前⇒函館駅前 は快速便となり，主要停留所のみの停車となる。