函館バスにおける日吉営業所管轄分を紹介する。なお，経由地に関しては主要な停留所を表記している。
※学休ダイヤ⇒日曜・祝日および学休日（学休日の土曜日も含む）は運休することを表している。
・⇔は往復運行あり，⇒は片道運行のみ をそれぞれ表している。なお，片道しか通らない場合は，　   わかりやすくするために（）を付け加えている。
・［］表記に関しては，一部便で経由することを示している。
・2019年4月1日より系統番号は変更となったが，旧系統番号もあわせて表記している。
・函館駅前停車の系統は，わかりやすくするために乗り場（①や②など）の表記も加えた（なお，バスセンター行きの便が函館駅前に停車する場合は全て 7番乗り場 となる）。

16系統 〈16系統〉
・日吉営業所⇔団地通⇔花園町⇔稲荷神社前⇔深堀町⇔五稜郭⇔ガス会社前⇔市立函館病院⇔北大前⇔津軽海峡フェリー
※一部便では昭和営業所も担当している。

16A系統 〈116系統〉
・日吉営業所⇔団地通⇔花園町⇔稲荷神社前⇔深堀町⇔五稜郭⇔ガス会社前⇔市立函館病院⇔北大前⇔津軽海峡フェリー⇔石田文具前⇔久根別⇔上磯駅前通⇔富川会館前
※2018年4月に新設。2020年3月までは土日祝日のみであったが，4月より平日も運行となった。
※一部便では昭和営業所も担当している。

33A系統 〈33系統〉　※1日1本（休日は学休ダイヤ）
・ななえ新病院⇒七飯役場通⇒鳴川⇒大中山⇒桔梗⇒昭和⇒昭和ターミナル⇒亀田中学校前⇒亀田支所前⇒五稜郭⇒千代台⇒昭和橋⇒函館駅前⇒バスセンター
※2023年10月より函館営業所から管轄が変更（土曜日は函館営業所が担当する）。

59系統 〈59系統〉　※1日1本（平日のみ運行）
・旭岡中学校前⇒旭岡生協前⇒旭岡団地⇒トラピスチヌ入口⇒湯倉神社前⇒湯川中学校前⇒花園町⇒東本通⇒東山団地⇒神山通⇒亀田支所前⇒五稜郭⇒千代台⇒昭和橋⇒函館駅前⇒バスセンター
※2024年4月より，平日のみの片道運行かつ函館営業所から管轄が変更（2023年3月までは，一部便にて昭和営業所も担当していた）。

60系統 〈60系統〉　※平日・土日祝日共通ダイヤ（一部便では土日祝日のみの便あり）
・日吉営業所⇔山の手団地⇔世界救世教前⇔本通中学校前⇔吉田眼科病院⇔本通小学校前⇔中央図書館前⇔五稜郭⇔千代台⇔昭和橋⇔函館駅前⑤
※平日は1往復のみ。
※2018年11月より函館営業所から管轄が変更。

60B系統　※復路は，元町⇒日吉営業所行き となる。
・日吉営業所⇔山の手団地⇔世界救世教前⇔本通中学校前⇔吉田眼科病院⇔本通小学校前⇔中央図書館前⇔五稜郭⇔昭和橋⇔函館駅前④・⑤⇔十字街⇒函館西高校前
※2020年10月に新設。
※日吉営業所発便の函館駅前は4番のりばとなり，復路は5番のりばとなる。

62系統 〈3系統〉　※平日のみ
・日吉営業所⇔臨空工業団地通⇔東山見晴台団地下⇔日吉営業所（⇒団地通）⇔東本通⇔吉田眼科病院⇔工業高校前⇔大妻高校前⇔市立函館高校前⇔芸術ホール前⇔五稜郭病院前⇔五稜郭⇔函館税務署入口⇔中の橋⇔棒二森屋前⇔市役所前

63系統 〈31系統〉
・日吉営業所⇔北中学校通⇔世界救世教前⇔東本通⇔吉田眼科病院⇔工業高校前⇔大妻高校前⇔市立函館高校前⇔芸術ホール前⇔五稜郭病院前⇔五稜郭⇔函館税務署入口⇔中の橋⇔棒二森屋前⇔市役所前

73系統　※土曜日は，函館大学前⇒ななえ新病院行き の1本のみ（学休ダイヤ）
・ななえ新病院⇔七飯高校前⇔鳴川⇔北大川⇔大川⇔函館高等支援学校⇔美原台団地⇔附属中学校前⇔亀田支所前⇔神山通⇔東山団地⇔東本通⇔花園町⇔湯川中学校前⇔湯倉神社前⇔函館大学前
※2023年10月より日吉営業所も担当（北大川発便および土曜日は函館営業所が担当する）。
※平日朝の1本は 北大川⇒函館大学前行き が存在している（学休日は運休）。

73A系統　※1日1本，平日朝のななえ新病院⇒函館大学前行き は学休日運休
・ななえ新病院⇔七飯役場通⇔鳴川⇔北大川⇔大川⇔函館高等支援学校⇔美原台団地⇔附属中学校前⇔亀田支所前⇔神山通⇔東山団地⇔東本通⇔花園町⇔湯川中学校前⇔湯倉神社前⇔函館大学前
※2023年10月より日吉営業所も担当（ななえ新病院発便および土曜日は函館営業所が担当する）。
※土曜日は，ななえ新病院⇒函館大学前行き のみの1本となる（学休ダイヤ）。
〈73系統および73A系統はもともと 9-3系統〉

74系統 〈94系統〉　※平日・土日祝共通ダイヤ（一部便では平日のみの便あり）
・日吉営業所⇔団地通⇔東本通⇔東山団地⇔神山通⇔亀田支所前⇔亀田中学校前⇔昭和ターミナル⇔蔦屋書店前⇔昭和⇔五稜郭駅前⇔ガス会社前⇔函館駅前②
※蔦屋書店前⇔昭和 間は，往路と復路で経路が少し異なる。
※2013年4月に昭和営業所より管轄が変更。

75系統 〈29系統〉　※平日・土日祝日共通ダイヤ（日吉営業所発便では平日のみの便あり）
・日吉営業所⇔団地通⇔花園町⇔湯川中学校前⇔湯倉神社前⇔湯川団地中央⇔函館空港
※2017年11月に新設。

81系統 〈34系統〉　※平日・土日祝日共通ダイヤ（均一料金，一部便はデマンドバス対応）
・［東山見晴台団地下⇒］日吉営業所⇒ラ・サール高校裏⇒湯川支所前⇒湯倉神社前⇒フレスポ戸倉前⇒函館大学前⇒香雪園⇒フレスポ戸倉前⇒湯倉神社前⇒湯川支所前⇒ラ・サール高校裏⇒日吉営業所［⇒東山見晴台団地下］
※東山見晴台団地下 は，電話予約があったときのみ運行。
※以前は，日吉営業所⇔ラ・サール高校前⇔湯川支所前⇔湯倉神社前⇔上野町⇔香雪園⇔函館大学前 の経路であった。

85系統 〈5系統〉
・日吉営業所⇔団地通⇔花園町⇔稲荷神社前⇔深堀町⇔人見町⇔中部高校前⇔的場町⇔昭和橋⇔函館駅前③
※一部便では昭和営業所も担当している。

96系統 〈96系統〉　※平日・土日祝日共通ダイヤ
・函館駅前③⇔啄木小公園⇔金堀町⇔広野町⇔湯の川温泉⇔湯川3丁目⇔湯川団地中央⇔函館空港
※2020年5月より函館営業所から管轄が変更（一部便では函館営業所も担当している）。

7A系統
・函館空港⇒湯川団地中央⇒湯倉神社前⇒深堀町⇒五稜郭⇒亀田支所前⇒神山通⇒東山団地⇒東本通⇒花園町⇒湯川中学校前⇒湯倉神社前⇒湯川団地中央⇒函館空港

7B系統
・函館空港⇒湯川団地中央⇒湯倉神社前⇒深堀町⇒五稜郭⇒亀田支所前⇒神山通⇒東山団地⇒東本通⇒花園町⇒湯川中学校前⇒湯倉神社前⇒湯川団地中央⇒瀬戸川町⇒函館空港

7E系統
・函館空港⇒湯川団地中央⇒湯倉神社前⇒湯川中学校前⇒花園町⇒東本通⇒東山団地⇒神山通⇒亀田支所前⇒五稜郭⇒深堀町⇒湯倉神社前⇒湯川団地中央⇒函館空港

7F系統
・函館空港⇒瀬戸川町⇒湯川団地中央⇒湯倉神社前⇒湯川中学校前⇒花園町⇒東山団地⇒東本通⇒神山通⇒亀田支所前⇒五稜郭⇒深堀町⇒湯倉神社前⇒湯川団地中央⇒函館空港
〈※7A・B・E・F系統はもともと とびっこ〉

なお，11系統（増発便のみ）・19系統・30系統・30A系統・33系統・72系統・82系統・95系統 の一部便も担当している。